El LagoTaal está situado en una región sumamente poblada y crecientemente agrícola e industrial. El Gobierno filipino ha designado la región Taal como un sitio favorecido para establecer nuevas industrias e infraestructuras. La región entera que rodea el Lago Taal es de riesgo volcánico.
La pesca intensiva es uno de los problemas más grandes así como la contaminación del lago por lasaguas residuales de las industrias y las casas. El desarrollo insostenible presenta también una importanteamenaza al lago.
El Lago Taal es la casa de la venenosa " la serpiente de mar " negra y blanca(Hydrophis semperi). Esta especie es uno de sólo unos cuantos serpentean de su tipo que se reproducen en de agua dulce. El Lago Taal es también el hábitat de líder mundial de la sardina sólo de agua dulce, Sardinella tawilis
